Biogéologie
Plateforme de microscopie et de microbiologie
Site géographique : ENS de Lyon, bâtiment M8
Responsables scientifiques : Laurence Lemelle et Matthieu Amor
Adresses email : laurence.lemelle@ens-lyon.fr et matthieu.amor@ens-lyon.fr
Présentation de la plateforme
La plateforme de biogéologie de l’ENS de Lyon au sein du LGL est un environnement essentiel pour la préparation et l’analyse des échantillons microbiologiques, ainsi que la compréhension approfondie de mécanismes de comportement de bactéries avec leurs environnements et de biominéralisation. Elle combine des équipements standards permettant les cultures microbiologiques en conditions contrôlées avec des instruments sophistiqués tels que des microscopes optiques de pointe ou un tritrateur permettant des synthèses minéralogiques.
La plateforme de microbiologie et microscopie est un lieu essentiel pour la recherche en biogéologie et biophysique, offrant un environnement sécurisé et technologiquement avancé pour l’observation et l’analyse des microorganismes. Grâce à la collaboration entre les technicien.ne.s qualifié.e.s et les chercheur.euse.s, cette plateforme joue un rôle central dans la découverte de nouveaux savoirs et l’amélioration de la compréhension de la (géo)microbiologie.
La plateforme est normalement gérée par un.e technicien.ne hautement qualifié.e en microbiologie et microscopie. Ce professionnel est responsable de la maintenance des équipements, de l’assistance aux chercheurs dans l’utilisation des microscopes, de la préparation des échantillons, de la gestion des cultures microbiennes et de la garantie du respect des protocoles de sécurité.
Microscopes avancés : La plateforme de microscopie dispose d’une gamme de microscopes optiques haut de gamme, permettant des observations en champ sombre, en lumière polarisée ou en fluorescence. Ces instruments permettent l’observation de micro-organismes à des échelles inférieures au micromètre.
Salle de microscopie spécialisées : La salle de microscopie est conçue pour maintenir des conditions de température, d’humidité et d’éclairage appropriées pour les différentes techniques de microscopie optique. Elle est également équipée d’un système de filtration d’air pour garantir un environnement propre.
Laboratoires de microbiologie : Des paillasses de microbiologie sont présentes pour la préparation, la culture et l’analyse des échantillons biologiques. Les laboratoires sont également équipés d’une hotte à flux laminaire, de matériel de chimie pour la préparation des milieux de culture (pH mètre, balance de précision…), de microscopes optiques pour le contrôle des cultures, d’un congélateur -80 °C, ou encore de spectrophotomètres et d’incubateurs permettant de travailler sous atmosphère contrôlée.
Formation et assistance aux chercheurs : Le technicien offre une formation aux chercheurs sur l’utilisation appropriée des microscopes et des équipements de microbiologie. Il les conseille sur les meilleures pratiques et les protocoles de manipulation des échantillons.
Systèmes d’imagerie et d’analyse : En plus de l’observation visuelle, la plateforme est équipée de systèmes d’imagerie avancés pour la capture d’images à haute résolution. Des logiciels d’analyse d’images sont également disponibles pour aider à extraire des données quantitatives à partir des images microscopiques.
Système de minéralisation : La plateforme est équipée d’un système de tritration pH (système OMNIS commercialisé par Metrohm) permettant de réaliser des synthèses minérales. Il permet de maintenir les conditions physico-chimiques de l’expériences (température, pH…) et d’ajouter des réactifs dans la solution de synthèse.
Stockage et archivage des données : Pour garantir l’intégrité des données, la plateforme dispose de systèmes de stockage sécurisés pour archiver les images et les résultats de recherche. Cela permet un suivi continu des expériences et la possibilité de partager les données avec d’autres chercheurs.
Sécurité et biosécurité : Des protocoles stricts de sécurité et de biosécurité sont mis en place pour minimiser les risques. Le technicien en accord avec le service hygienne et sécurité et les chercheurs concernés assure le respect de ces protocoles.
Collaboration interdisciplinaire : La plateforme encourage la collaboration entre chercheurs issus de différentes disciplines, favorisant ainsi une approche holistique de la recherche en en (géo)microbiologie.
Équipements de pointe : La plateforme s’efforce constamment de rester à la pointe de la technologie en investissant dans de nouveaux équipements et en maintenant les normes de qualité les plus élevées.